Fakulteta je bila kot visoka strokovna šola in kot samostojni visokošolski zavod ustanovljena leta 1997. Prve študente je vpisala v študijskem letu 1998/1999.
V letu 2016 se je preoblikovala v fakulteto, v letu 2018 pa je skupaj z Univerzo v Novem mestu Fakulteto za poslovne in upravne vede, Univerzo v Novem mestu Fakulteto za strojništvo in Univerzo v Novem mestu Fakulteto za zdravstvene vede ustanovila Univerzo v Novem mestu in postala njena članica.
Fakulteta ima koncesijo Vlade Republike Slovenije za izvedbo dveh javno veljavnih študijskih programov, in sicer:
- za visokošolski strokovni študijski program Upravljanje in poslovanje (podeljena 23. 12. 1998, začetek izvajanja: 01. 10. 1999) ter
- za visokošolski strokovni študijski program Poslovna informatika (podeljena 27. 12. 2007, začetek izvajanja: 01. 10. 2008),
- za visokošolski strokovni študijski program Upravljanje z okoljem (podeljena 10. 2. 2022, začetek izvajanja: 01. 10. 2022).
Poleg omenjenih, fakulteta izvaja tudi javno veljavne magistrske študijske programe (študijske programe tretje stopnje) Upravljanje poslovnih in informacijskih sistemov, Poslovna ekonomija in Upravljanje z okoljem.